Миссии являются основными компонентами в игре. От одного до четырех игроков могут участвовать в них одновременно ,чтобы достичь цели (целей) и получить награду. При прохождении миссии соло, уровень сложности будет оставаться прежним. Каждая из 207 миссий имеет заранее определенную цель, которая может изменяться в ходе игры (это происходит случайным образом). Внутриигровая зона в миссиях генерируется случайным использованием заранее разработанных комнат и залов, а так же есть шанс появления враждебного окружения. Каждая миссия также обычно содержит одну конкретную фракцию врага, но в ходе миссии существует вероятность появления другой фракции, в этом случае они будут сражаться друг с другом. Также в каждой миссии для каждого игрока доступны опциональные испытания.
Типы миссий
В настоящее время существует 11+1 побочный типов миссии в Warframe. Вторичные миссии или вторичные цели могут быть добавлены случайным образом вне зависимости от основного задания, но они не известны и не доступны, пока основная миссия не будет завершена.
Миссии
Выживание • Диверсия • Захват • Зачистка • Мобильная Оборона • Оборона • Саботаж • Спасение • Спасение 2.0 • Убийство • Шпионаж • Перехват • Налёт • Додзё • Конклав • Побег