Шутер от первого лица, который является продолжением Soldier of Fortune, вышедшего в 2000 году. В игре вы вновь в роли Джона Маллинса, наёмника, который работает на тайную организацию под названием The Shop.

В Soldier of Fortune 2: Double Helix вы отправляетесь на различные миссии по всему миру, чтобы предотвратить распространение смертельного вируса, который может уничтожить человечество. Вирус был создан террористической группой под названием «Прометей», которая планирует использовать его как биологическое оружие. Вам придётся сражаться с врагами в разных локациях, таких как Колумбия, Гонконг, Камбоджа, Кувейт и Россия. В игре есть разнообразный арсенал оружия, от пистолетов и дробовиков до снайперских винтовок и гранатомётов. Вы также можете использовать ножи, бинокли и детекторы мин для выполнения своих задач.

Одной из особенностей игры является система повреждений, благодаря которой игра обладает реалистичными эффектами крови и травм на телах врагов. Вы можете стрелять по разным частям тела врагов и наблюдать за тем, как они реагируют на попадания. Например, вы можете отстрелить ногу или руку врага и он будет хромать или кричать от боли. Вы также можете убить врага одним выстрелом в голову или сердце. Эта система повреждений делает игру более жестокой и реалистичной.

Сюжет игры разделен на пять частей, каждая из которых состоит из нескольких уровней. В каждой части вы сталкиваетесь с новыми противниками и заданиями.