Вот написал тут патчик для русской версии Dungeon Siege от 8-Bit.
Устраняет эту проблему прокачки магии. Возможно работает и для других локализаций, если это так, плиз сообщите об этом.
Ссылка на патч:
http://mgames.mnet.uz/index.php?play=400
Рекомендую все же сделать резервную копию файла Logic.dsres
а на английскую версию есть?
У меня версия от Навигатора. Страдает тем же глюком, но к сожалению твой патч не помогает.