Hacker Evolution погружает в атмосферу тайных компьютерных гениев, взламывающих сложные системы кибербезопасности в погоне за конкретными целями. Игрок берёт на себя роль бывшего разведчика, решившего специализироваться в сфере хакинга.

И вот, в результате глобальных и труднопредсказуемых мировых событий, рушится доступ к центральным базам данных по всей планете. Узнав об этом, главный герой берёт расследование в свои руки и начинает изучать имеющуюся информацию, чтобы выяснить истинные причины случившегося.

Рухнули фондовый рынок, центральный банк, спутниковые линии связи и трансокеанские оптоволоконные кабели — все базовые системы человечества. Это больше походит на масштабный теракт, призванный послужить серьёзным предупреждением всему миру. Чтобы защитить гражданское население планеты, главному герою придётся применить весь свой опыт взлома и программирования, раскрыв этот масштабный компьютерный заговор.