Это третья часть популярной серии Patapon, в которой игроки управляют племенем маленьких созданий, известных как патапоны.

Геймплей основан на сочетании ритма и стратегии, где игроки должны использовать разные комбинации барабанных ударов, чтобы направлять патапонов на сражения с врагами, исследовать мир и решать различные задачи. В Patapon 3 геймплей был усовершенствован и дополнен новыми классами патапонов, более сложными уровнями и улучшенной системой прокачки персонажей.

Сюжет Patapon 3 начинается с того, что патапоны случайно освобождают древнее зло, которое погружает их мир во тьму. Игроки должны возглавить патапонов в их борьбе против могущественных сил зла, чтобы вернуть свет в мир и спасти своих сородичей.