Сюжетно-ориентированное приключение с элементами научной фантастики, в котором игроки берут на себя роль Айзека, полугодовалого младенца, обладающего таинственными экстрасенсорными способностями.

В центре повествования — стремление главного героя обрести любовь и принятие своей семьи. Однако на пути Айзека встаёт могущественная технологическая корпорация, желающая использовать его уникальные способности в своих целях. Игрокам предстоит погрузиться в эмоциональную историю о борьбе за своё место в мире и противостоянии зловещим силам, угрожающим разрушить жизнь главного героя.

Одной из особенностей Goodnight Universe является управление, основанное на отслеживании движений лица игрока через веб-камеру. Эта механика напоминает геймплейное решение, использованное в игре Before Your Eyes, где моргание служило ключевым элементом интерактивности.