Harmonium представляет собой музыкальное приключение, в центре которого оказывается глухая филиппино-американская девочка Мелоди Макато. Мелоди родилась глухой, но это никогда не мешало ей наслаждаться музыкой. Она чувствовала ритмы и мелодии, вибрирующие сквозь пол. Для Мелоди музыка была живой и яркой, исполненной красок и форм. Она мечтала поделиться этим ощущением со своими друзьями и создать новый музыкальный жанр, доступный всем.

И вот однажды Мелоди отправилась в путешествие по сказочной стране под названием Гармония. Это был чудесный мир, где каждая мелодия обретала видимую форму.

Однако в Гармонии царит хаос. Злая сила под названием Какофония стремилась разрушить этот мир. Мелоди поняла, что только она может спасти Гармонию. Для этого ей нужно сочинить великую симфонию, способную победить Какофонию.