События игры развиваются в разрушенном мире, заражённом ядовитыми грибами, а в роли главной героини выступает единственная выжившая девочка Торико и её робот-помощник. Поскольку Торико будет тяжко выживать в загрязнённом мире одной, ей на подмогу приходит игрок, берущий управление над роботом-помощником, который должен активно поддерживать благоприятную среду в Террариуме, в котором Торико проводит каждый день.