Новая сюжетная линия в серии Atelier. Игра рассказывает о подвигах девушки-подростка по имени Риза, которая мечтает сбежать от своего мирского деревенского образа жизни вместе со своей группой озорных друзей.
Однажды, исследуя запретный остров в поисках приключений, они встречают пожилого мага, который навсегда изменит их жизнь. После некоторого убеждения старик начинает учить Ризу очаровательным способам алхимии; отправляя её в приключение, которое в конечном итоге приведёт её к поискам спасения её родного города от таинственной и смертельной тьмы, скрывающейся под поверхностью.
