Симулятор подводной лодки, в котором игрок берёт на себя роль капитана немецкой подводной лодки типа VII во время Второй мировой войны и выполняет различные миссии.

Геймплей Silent Hunter 2 состоит из двух режимов: кампании и одиночных миссий. В кампании игрок должен следовать историческому сценарию, начиная с 1939 года и заканчивая 1945 годом. В ходе кампании игрок может улучшать свою подводную лодку, нанимать и обучать экипаж, получать награды и звания. Кампания состоит из 12 миссий, каждая из которых имеет свои цели и условия. Например, в одной из миссий игрок должен атаковать конвой союзников, а в другой — проникнуть в базу противника.

Одиночные миссии позволяют игроку выбрать любую подводную лодку из доступных в игре и задать свои параметры для миссии, такие как время, погода, противники и т.д. Одиночные миссии более свободны и разнообразны, чем кампания, и подходят для тех, кто хочет просто насладиться игрой без ограничений.