В Fate/EXTELLA вы оказываетесь в цифровом мире SE.RA.PH, где разворачивается новая Война Святого Грааля. На этот раз вам предстоит не только сражаться с другими Мастерами и их Слугами, но и противостоять таинственной угрозе, которая может уничтожить SE.RA.PH или разделить его на части. Вы будете играть за трёх главных героинь — Неро, Тамамо и Альтеры, каждая из которых имеет свою собственную историю и мотивы. Кроме того, вы можете открыть множество побочных историй, которые раскроют вам больше деталей о мире игры и её персонажах.