Спустя пять лет после событий XCOM 2, люди и инопланетяне пытаются жить в мире и начинают возрождать цивилизацию. К глубокому сожалению, не все жители Земли одобряют сотрудничество между разумными расами.
Возьмите под своё командование штурмовую группу из людей и инопланетян, которые должны действовать сообща, чтобы нейтрализовать скрытую угрозу для города. Вам необходимо использовать бойцов, чтобы расследовать и пресекать диверсии, угрожающие кварталам Города-31.