В Claire de Lune вы играете за контрабандиста Джона, который находится в бегах вместе со своей дочерью Клэр. Отец и дочь потеряли друг друга после того, как их корабль потерпел крушение на неизвестной планете. Теперь Джону необходимо найти Клэр, отремонтировать корабль и покинуть чужую планету. Во время исследования планеты Джон находит странный заброшенный исследовательский комплекс.
Вооружившись своим верным нанопистолетом, Джон, вместе с ИИ-компаньоном Артуро, должны преодолеть коварную поверхность планеты и поподробней изучить загадочный исследовательский комплекс.